根据《中共镇江市委、镇江市人民政府关于镇江市市级党政机构改革的实施意见》镇发(2001]34号)，中共镇江市委党校为市委直属事业单位，正处级建制，参照国家公务员制度管理，挂"镇江市行政学院"的牌子。
一、主要职责
(一)根据市委对我市于部队伍建设的要求，做好对准备进入市级机关局级副职、科级正职和乡镇主要领导岗位的青年后备干部的培训工作;有计划地完成市级机关用级副职和科级、县(市)级机关局级正职、乡镇长及相当级别的党员干部的轮训任务;培训青年党员干部和理论宣传骨干;根据公务员培训计划，实施公务员初任培训、任职培训和更新知识培训工作;负责对学员在校学习期间的表现进行考核，提出使用建议。
(二)研究马列主义、毛译东思想、邓小平理论和党的路线、方针、政策，围绕党中央的战略部署和市委、市政府的重要决策，结合镇江市情进行调查研究，为市委、市政府提供决策参考，为教学和社会实践服务。
(三)受市委、市·政府委托举办较高层次的专题研讨班、读书班。研讨市委、市政府提出的方针政策问题。办好委托培训、轮训。
(四)对县(市)区的党校进行业务指导。
(五)运用函授等学历教育形式，对全市在职党员干部进行不脱产培训。
(六)完成市委、市政府交办的其它任务。
二、内设机构
根据上述职责，中共镇江市委党校(镇江市行政学院)内设12个职能处室(科级建制)。
(一)办公室
协助校(院)领导组织校(院)内日常工作的运转，负责了解、反映各部门对上级指示、校(院)决议等贯彻情况，并进行检查督促;负责校(院)内外的联系、秘书事务、宣传、会议、机要、文书档案、信访、外事、保密、编辑《党校通讯八办公车辆管理等工作。

(二)组织人事处
负责机构编制、人员调配、职务任免、考核奖惩、劳动工资等具体管理事宜;承办全市党校系统专业技术职务评审的有关工作，管理全校人事档案;承办木校(院)出国、出境人员的政审及报批工作;负责校内干部、1人的培训管理，负责全校(院)离退休人员的管理服务工作。负责校 (院)内机关党的组织建设、思想政治工作和纪律检查及监察工作;指导校(院)工会、共青团、计划生育和妇女工作，组织开展文体活动。
(三)行政处
负责校(院)内基木建设、校 (院)产物资管理和校园环境、秩序的管理，负责安全保卫和人武、医疗保健工作;负责全校的经费管理，组织编制经费的年度预算并进行年度决算，组织全校(院)预算内和预算外资金的筹集、分配和监督，进行会计核算，实行财务审计监督。
(四)教务处
负责编制和组织实施党校和行政学院教学计划，管理、协调教学活动，负责枝内班次的招生报名、考试录取、教育管理工作。根据公务员管理部门的统一安排，承担公务员培训的任务，主要是初任培训、任职培训、专门业务培训和知识更新培训;承担全市其它公务员施教机构骨干教师的培训。管理学籍，掌握教学进度与动态，反映教学情况，研究并提出教学工作改革方案，做好校(院)内教师教学质量考核评估和教师培训进修等相关工作。
(五)函授处(挂"江苏省干部函授学院镇江分院"的牌子)
负责中央党校函授学院镇江学区和江苏省干部函授学院镇江分院的函授教学组织和管理工作，运用函授形式对党员干部进行培训，对全市各函授教学点进行业务指导。
(六)成人教育处
根据我市人才培养规划和社会发展需要，拓宽成人教育渠道，开展联合办学，培养急需人才。
(七)马列主义教研室
承担马列主义、毛泽东思想和邓小平理论的教学研究工作，主要包括马克思主义哲学、政治经济学、科学社会主义、党建党史的教学研究工作。
制定和落实本教研室的教学实施计划，开展教学活动。组织教学研究、调查研究和理论研究。结合学校总体部署，具体安排本教研室和教师的各项工作。
(八)行政管理教研室
负责行政管理、领导科学、心理学、办公自动化等学科的教学研究工作。负责宪法、刑法、民法、行政法、经济法等国家一系列法律、法规和政治学、国际政治学等学科的教学研究工作。
制定和落实本教研室的教学实施计划，开展教学活动。组织教学研究、调查研究和理论研究。结合学校总体部署，具体安排木教研室和教师的各项工作。
(九)经济教研室
负责马克思主义特别是邓小平经济理论、世界经济、经济管理、经济学说史等学科的教学研究工作。当前，要加强外经外贸外资的教学研究工作。
制定和落实本教研室的教学实施计划，开展教学活动。组织教学研究、调查研究和理论研究。结合学校总体部署，具体安排本教研室和教师的各项工作。
(十)科研处
负责编制和督促执行全校(院)科研规划，指导组织全校(院)的科研、调研工作;协调和组织枝(院)和全市党枝系统成果的评估工作，管理科研档案;牵头管理依托于党校和行政学院的各类学会;负责联办《镇江学刊》的有关工作。研究马克思主义、毛泽东思想、邓小平理论和国内外及我市的重大现实问题，为提高教学质量服务，为市委、市政府的决策服务，为社会主义现代化建设服务。努力开展多种形
式的学术活动。
(十一)图书信息中心
管理图书和报刊杂志等资料。负责图书、报刊等各类文献信息资料的采集、分编、应用与管理、开发和研究，为教学和其他方面提供咨询和信息服务。
负责计算机、网络等现代化办公设备硬软件的管理、维护、研究和开发应用及电化教学的保障工作。负责管理学校电子信息网络。
(十二)后勤管理处
负责全校(院)的膳食、住宿等生活服务，组织校(院)产
物资及生活设施的维修保养工作，负责全枝(院)实业及经
营的管理，兴办枝(院)第三产业，为办好枝(院)积极增加收
入，改善办学条件，做好后勤服务人员的管理工作。
另按有关规定设立工会、团委，并配备相应职教。